Damit das Magicpacket über VPN angenommen wird muss lediglich die aufzuweckende Machine im Arptabel in der Firewall eingetragen werden. Hier ein Beispiel:

config system arp-table
    edit 1
        set interface "intern"
        set ip 192.168.1.90
        set mac 00:01:2e:52:2f:40
    next
end

Zum Aufwecken VPN aufbauen und folgenden Befehl eingeben:

wakeonlan -p 7 -i 192.168.1.90 00:01:2e:52:2f:40

Hierfür gibt es auch nette Apps für Android. Das ganze kann natürlich auch ohen VPN tun. Hierfür muss man ein Portforwarding einrichten.